1.甘蔗生产机械研究中心

    根据甘蔗生产全程机械化的要求，研究甘蔗地耕整机械、甘蔗种植机、甘蔗中耕管理机、中小型甘蔗收获机，研究甘蔗叶、甘蔗渣等副产综合利用技术与装备，研究甘蔗农机与农艺相结合关键技术等。

2.田间作业机械研究中心

    研究主要热带作物机械化田间作业技术及装备，包括机械化耕作、种植、管理（中耕、施肥、植保、节水灌溉等）、收获及更新作业技术与装备，重点解决木薯、香蕉、橡胶等热带作物机械化田间作业装备及其农机农艺相结合关键技术。

3.农产品加工装备研究中心

    研究热带农产品加工特性，加工工艺、技术，研制配套的加工机械装备。重点研究中小型棕榈油提取与精炼加工成套装备，澳洲坚果加工装备，咖啡、胡椒、橡胶、剑麻初加工装备技术升级。

4.农村能源装备研究中心

   研究热带农业固体废物资源能源化利用技术与配套机械、设施，包括干法发酵沼气技术与装备、设施，秸秆成形燃料技术与配套装备，太阳能与风能技术在热带农业生产的集成应用。

5.天然纤维装备与制品研究中心

    研究利用菠萝叶、香蕉茎杆等热带作物秸秆提取纤维的相关技术与设备，研究纤维的基本理化特性和功能、改性和精细化处理技术及设备，研发纤维纺织开发技术与纺织产品，研发纤维的产业用途。

6.海洋水产与畜牧机械研究中心

    研究挖塘清淤机械、增氧机械、水质净化机械、投饲机械等热带/亚热带海洋水产养殖机械，鱼类加工机械、虾类加工机械、冷冻干燥机械等水产品加工机械。开展热带作物秸秆饲料化利用技术与秸秆饲料制备机械、营养评价及其禽畜养殖试验研究。